甲苯胺藍是常用的人工合成染料的一種，屬于醌亞胺染料類，其種類主要有電泳試劑、色譜試劑、離心分離試劑、免疫試劑、標記試劑、組織化學試劑、透變劑和致癌物質、殺蟲劑、培養基、緩沖劑、電鏡試劑、蛋白質和核酸沉淀劑、縮合劑、超濾膜、臨床診斷試劑、染色劑、抗氧化劑、防霉劑、去垢劑和表面活性劑、生化標準品試劑、生化質控品試劑、分離材料等等。
甲苯胺藍應用常見問題：
1、線性范圍變窄現象：高值測不高。原因：生產試劑時有效成分投料量不足；試劑成份穩定性較差。
2、靈敏度變低現象：酶促反應速度曲線斜率下降，測定結果有嚴重系統誤差。原因：試劑底物濃度不足。
3、低值偏高現象：試劑空白的變化曲線(吸光度VS時間)明顯波動。原因：試劑自身不穩定，自行分解；工具酶純度不夠，雜酶含量超限，導致干擾作用。
甲苯胺藍一般含有兩個發色團，一個是胺基，一個是醌型苯環，來構成色原顯色。染料除有發色團外，還要有能使色原對組織及其他被染物產生親和力的原子團即助色。助色團能促使染料產生電離成鹽類，幫助發色團對組織產生染色力，使切片上的組織細胞著色。
不僅含有兩個發色團，還含有兩個助色團，為堿性染料，陽離子有染色作用，組織細胞的酸性物質與其中的陽離子相結合而被染色。可染細胞核使之呈藍色；肥大細胞胞質內含有肝素和組織胺等異色性物質遇到甲苯胺藍可呈異染性紫紅色，可用于尖銳濕疣的初篩及肥大細胞的檢測。
