NEB內切酶可提供210多種內切酶，其中有130多種內切酶為重組酶。重組技術的運用，使NEB能在提高內切酶的純度及品質的同時，削減生產費用。
加入酶之前將反應混合物混勻，可以用移液槍上下吹打或輕彈管壁，然后在離心機中快速離心。切忌振蕩混勻。
一般情況下，我們推薦使用5-10單位酶量/μgDNA，基因組DNA用10-20單位酶量消化1小時。入內切酶的量應不超過總體積的10%，以避免甘油過量引起的星號活性。貯存液中的添加物和底物溶液中尚存的殘余物（會導致小體積反應出現問題。如果在切割底物DNA時遇到了問題，建議加入以下對照實驗：
1、酶切對照DNA（含有多個已知內切酶切割位點的DNA，如LambdaDNA或腺病毒-2DNA），以檢測內切酶的活性。
2、如果對照DNA能夠被切割而實驗中的底物DNA不能，可以將這兩種DNA混合在一起再進行酶切，以檢測實驗用的底物DNA中是否存在抑制反應的物質。如果確實存在某種抑制因子（通常為鹽、EDTA或酚），則混合之后對照DNA也不能被切割。
3、當內切酶在非zui適條件下使用時可能會產生星號活性。
4、可以通過以下方法降低星號活性：使用高保真（HF）內切酶、縮短溫育時間、使用省時內切酶或者增大反應體積。
